生物医学の主張は、進む前に監査する。

会社情報 名前のある責任、制御された経路。 登録代理人または業務用郵送経路のみ。私的な住居は公開しません。 出典 ソース台帳 公開文ごとに追跡可能な出典、状態ラベル、欠落資料の注記を付けます。 負荷 ブレークテスト 主張を進める前に、QC フィルタ、正規化デフォルト、ドナー単位の支持を検証します。 判定 判定ライン survives、caveat、held ラベルは監査記録が書かれた後にのみ付きます。 02 出典をマップ データセット、組織、平台、アクセス、メタデータ、欠落を追跡します。 01 主張を受領 主張、判断文脈、有用または危険になる条件を特定します。 由来 出典台帳 すべての公開文には、表示、依頼制、欠落、保留のいずれかの出典状態が必要です。 監査 監査する 公開サイトとそのソースは、一緒に確認できるようにしています。 前処理 アンカーは疾患と一緒に動いたか？ ハウスキーパー遺伝子やスケール仮定は、安定させるはずの生物学を消すことがあります。 フィルタリング QC 感度 フィルターが解析前にストレス細胞や関連細胞を除いていないか確認します。 複製 コホート階層化 所見は主張を書く前に、コホート間の支持で分類します。 レビュアー向けパス 完全なレビューパスが必要ですか？ 深いページでソースマップ、方法行、図、ステータスラベルを確認できます。 連絡 一つのソースから始める。 役割、主張、ソースリンク、判断背景を送ってください。患者ファイルや治療依頼は送らないでください。 公式チャネル 公式チャネル 機微な資料を動かす前に、公開会社連絡の経路を確認してください。 セキュリティ セキュリティ連絡 公開サイトは静的で意図的に小さくしています。セキュリティ開示は現在 leng.jixiang@ninenames.com へ。 主張 主張トリアージ 方法レビュー前に、主張・判断文脈・危険な約束を整理する。 文脈 判断文脈 その主張が左右する判断を確認する。レビュー、資金、戦略、発表、臨床境界。 境界 範囲境界 確認できる範囲、除外する範囲、管理された引き渡しが必要な範囲を示す。 索引 ソース索引 論文、アクセッション、リポジトリ、図、欠落物を短く並べる。 データ アクセッション確認 指定データセットやリポジトリが到達可能で、現行で、実際に関連するか確認する。 文献 論文トレイル 論文が示すことと、後の要約・スライド・引用が示唆することを分ける。 アクセス データ可用性 材料が公開、要請制、欠落、ブロック、保留のどれかを示す。 メタデータ メタデータ注記 行列を信じる前に、ドナー、組織、段階、平台、アクセス、注意点を記録する。 生ファイル 生ファイルゲート 処理済み行列だけで、失敗モード検査に生リードが必要な場合に印を付ける。 QC QC 上限 固定フィルターが解析前にストレス細胞や関連生物を落としたか監査する。 ストレス ミトコンドリアストレス 高いミトコンドリア信号を自動廃棄ではなく問いとして扱う。 背景 環境 RNA 背景 RNA やサンプル処理が魅力的な信号を説明するか確認する。 細胞 ダブレット確認 混合細胞や多重細胞が偽のハイブリッド状態を作ったか確認する。 パイプライン 前処理経路 公開行列が存在する前に何が起きたか追跡する。 正規化 正規化アンカー データ安定化の参照が病気やストレスと共に動くか検査する。 アンカー ハウスキーパー変動 古典的ハウスキーピング遺伝子が主張に十分安定か確認する。 基線 ベースライン移動 比較基線が主張の下で動いたか確認する。 スケール スケーリング選択 信号が妥当な正規化とスケーリング選択に耐えるか比較する。 ドナー ドナー統計 細胞レベル信号がドナーレベルの証拠に耐えることを求める。 N ドナー数 細胞数だけでなく、何人の独立ドナーが信号を持つか示す。 統計 擬似反復 多数の細胞を多数の独立サンプルと混同する主張を止める。 大きさ 効果量 劇的な p 値より、効果量、不確実性、再現段階を優先する。 アッセイ バッチ / プラットフォーム 機器、化学、施設、バッチが信号を説明するか確認する。 化学 アッセイ版 研究比較前に化学条件とパイプライン版を追跡する。 段階 疾患ステージ 機序を重症度、段階、採取時期、生存者効果から分ける。 年齢 加齢フィルター 信号が疾患機序でなく加齢、虚弱、採取条件か検査する。 比較 疾患横断フィルター 物語が違うはずの疾患にも同じ信号が出るか確認する。 注釈 細胞型境界 注釈選択が細胞状態を作ったか消したか確認する。 反復 反復リード喪失 反復配列やレトロエレメント信号がカウント前に消えたか確認する。 注釈 注釈ロス 特徴は存在したが注釈層が数えられなかったか確認する。 行列 行列の盲点 処理済み行列だけでは判断できない信号を示す。 構造 タンパク質折りたたみ主張 予測構造を判定ではなく、信頼限界つき証拠として扱う。 信頼度 構造信頼度 モデル信頼度、ドメイン、無秩序領域、ツール限界超えを確認する。 変異 ドメイン / 変異 変異が主張されたドメインや機序に触れるか確認する。 支持 ウェット実験支持 計算、関連、摂動、直接実験支持を分ける。 引用 引用チェーン 慎重な表現が反復引用で強くなった箇所を探す。 図 図の来歴 各公開図をソース状態、キャプション限界、欠落物に結びつける。 視覚 公開図パック 公開安全な簡単な図を方法の道案内に使い、最終証明にはしない。 機序 機序マップ 信号を生物学的物語にする前に競合説明を地図化する。 降格 状態ダウングレード 強い検査が失敗するか支持が狭まる時、主張の強さを下げる。 訂正 訂正ループ 何がなぜ変わり、何がまた変え得るかを見える形にする。 注意 注意ラベル 読者が主張を見る場所に不確実性を付ける。 ゲート 再現ゲート 別コホート、アッセイ、ドナー確認が必要な主張を保留する。 保留 保留資料 資料の存在を示しつつ、管理対象や危険な詳細は公開しない。 台帳 公開台帳 将来の公開所見は、ソース、状態、安全、翻訳レビューが先。 パケット レビューパケット 管理された引き渡しにはソース地図、チェック、注意点、要請制資料を含められる。 デューデリ 信頼 / デューデリ 提携先や資金側の質問を範囲、機密性、判断文脈でルーティングする。 メール 最初のメール枠 役割、主張、ソースリンク、判断文脈だけで始める。 臨床 臨床境界 証拠支援は診断、治療、緊急指示にはならない。 安全 医療助言なし 公開文言を処方、緊急、患者別指示から切り離す。 プライバシー 患者ファイルなし 役割、目的、受取先、経路が明確になるまで患者ファイルは送らない。 プライバシー プライバシー経路 プライバシー、削除、データ権利の質問を公開 issue から外す。 法務 正式通知 法的・正式な連絡はマップ操作ではなく公式チャネルで扱う。 セキュリティ セキュリティ開示 脆弱性は公開コメントでなく責任ある開示経路へ送る。 公開 GitHub issue 公開訂正、翻訳バグ、ビルド問題、監査質問だけに使う。 言語 翻訳レビュー トーン、専門語、安全性を人が確認するまで下書き扱いにする。 言語 言語リスク 翻訳が誇張的または奇妙だと、良い主張も軽く見える。 管理 管理出典の境界 管理対象のソース表と敏感なレビュー資料を公開サイトに出さない。 会社 会社記録 会社名、ディレクター責任、公式チャネルの物語をそろえる。 責任者 ディレクター責任 実名責任は示しつつ、私宅や非公開研究資料は出さない。 リポジトリ 公開リポジトリ リポジトリはソース、ビルド可能性、issue 経路、訂正履歴を示す。 引き渡し 請求制の出典 一部の出典は公開名を出せても、役割と目的が明確になってから共有します。 修正経路 訂正依頼 公開上の誤りには、機密資料を出さずに訂正できる見える経路が必要です。 台帳 公開メソッド台帳 確認したこと、未確認のこと、レビュー後に変わったことを短く残す記録。 サンプル サンプル台帳 数える単位を見せる: ドナー、試料、組織、平台、時点、欠損フィールド。 境界 同意の境界 役割、目的、許可、受け手が明確になるまで機微な資料は動かさない。 破綻点 否定的証拠 主張を弱めた結果を文章の中に隠さず見える場所に残す。 衝突 矛盾インデックス 魅力的な物語に逆らう論文、データ、検査を並べる。 由来 由来スコア 公開主張が元ファイル、元方法、元の限界にどれだけ近いかを示す。 欠落 欠損データ地図 信頼を上げる前に、欠けたファイル、メタデータ、比較対象を名指しする。 図 チャート再構築 追跡できる入力から図を作り直してから、証拠として扱う。 選択 サンプル選択 誰がデータに入り、誰が外れ、その結果主張がどう変わるかを問う。 生存 生存者バイアス 残った試料が生物学なのか、選別を生き残った試料だけなのかを確認する。 層 性別層別 まとめた結果が性別に関係するパターンやアーティファクトを隠していないか確認する。 組織 組織ミスマッチ 血液、筋、脳、細胞、モデル系が本当に支えられる範囲を分ける。 時点 時点ウィンドウ 信号が発症、段階、採取間隔、介入時期に依存するかを確認する。 モデル 種間移行 動物やモデルの証拠がどこで止まり、人の証拠がどこから必要かを示す。 モデル 細胞株の境界 改変または不死化細胞が証明できること、できないことを明示する。 橋 バルク/単一細胞ブリッジ バルク組織と単一細胞の主張が同じ問いに答えているか確認する。 空間 空間文脈の喪失 分析前に消えた位置、近傍、組織構造を問う。 アイソフォーム アイソフォーム曖昧性 遺伝子レベル要約が転写産物レベルの違いを隠していないか確認する。 経路 経路の過剰適合 後から何でも説明できる経路ストーリーを疑う。 濃縮 遺伝子セット膨張 大きな遺伝子セットが弱い証拠を広く見せていないか問う。 ラベル オントロジーのずれ ラベル、病名、経路用語の意味が資料間で変わっていないか確認する。 AI モデル漏れ 訓練、調整、ベンチマーク重複が性能をきれいに見せていないか確認する。 ベンチマーク ベンチマーク不一致 検証課題が、その主張を使う実際の意思決定に合っているか問う。 汚染 訓練汚染 例、ラベル、答えがモデル開発に漏れていないか確認する。 構造 タンパク質折り畳み境界 もっともらしい構造と、証明済みの機序、標的、介入を分ける。 ドッキング ドッキング過剰主張 直交証拠が残らない限り、ドッキングは仮説のままにする。 試薬 抗体特異性 実際の条件で試薬が意図した標的を示しているか確認する。 信頼 信頼度の階段 主張が低い、慎重、有用、強い、引き渡し可のどれかを示す。 壊す条件 反証リスト 次の確認前に、何が出れば主張が弱まるか、壊れるかを書く。 次の検査 次の再現確認 不確実性を最小で有用な次の確認に変える。 計画 再現計画 強い主張に必要なコホート、資料、方法、停止ルールを定義する。 格下げ 格下げトリガー どの確認で強い主張が慎重な主張へ下がるかを明示する。 支持 支持トリガー どの確認で主張が興味深いものから使えるものへ進むかを示す。 保留 保留トリガー 主張を非公開、未完了、公開利用不可に保つ条件を示す。 質問 安全な質問 主張、出典リンク、判断文脈、境界から始める。機微なファイルは送らない。 規則 レビュー規則 深いレビュー前に、範囲、相手、機密性、許可された出力を合意する。 厳読 レッドチーム読み 資金、信頼、行動が動く前に、意図的に主張を壊そうとする。 調査 デリジェンス要約 残ったもの、失敗したもの、欠けたもの、次に聞くことへ圧縮する。 訂正 訂正窓口 危険な経路を使わずに、公開文言へ異議を出しやすくする。 領域 神経変性レーン 機序を語る前に、段階、組織、ドナー数、老化、横断コホートを監査する。 領域 筋疾患レーン 物語が固まる前に、損傷、再生、炎症、段階、採取を分ける。 領域 免疫シグナルレーン 免疫信号が原因、状態、処理、バッチ、組織混合のどれかを疑う。 領域 希少疾患レーン Nが小さい時は、小さい主張、明確な境界、見える欠損で扱う。 機序 機序レビュー・レーン 橋渡しが名付けられ検査された時だけ、関連から機序へ進む。 言語 翻訳品質レーン どの言語でも不自然または危険な表現は公開訂正として扱う。